org.utgenome.shell
クラス Illumina2Fastq

java.lang.Object
  上位を拡張 org.utgenome.core.cui.UTGBCommandBase
      上位を拡張 org.utgenome.shell.UTGBShellCommandBase
          上位を拡張 org.utgenome.shell.UTGBShellCommand
              上位を拡張 org.utgenome.shell.Illumina2Fastq
すべての実装されたインタフェース:
Comparable<org.xerial.util.opt.Command>, org.xerial.util.opt.Command

public class Illumina2Fastq
extends UTGBShellCommand


フィールドの概要
 
クラス org.utgenome.shell.UTGBShellCommand から継承されたフィールド
APP_FOLDER, EXPLODED_WEBAPP_DIR, SRC_FOLDER, WEBAPP_FOLDER
 
クラス org.utgenome.shell.UTGBShellCommandBase から継承されたフィールド
globalOption
 
コンストラクタの概要
Illumina2Fastq()
           
 
メソッドの概要
 void execute(String[] args)
           
 String getOneLinerDescription()
           
 String name()
           
 
クラス org.utgenome.shell.UTGBShellCommand から継承されたメソッド
compareTo, createContextXML, createFileFromTemplate, createFileFromTemplate, execute, getConfigFile, getHelpMessageResource, getObsolteConfigurationFile, getOneLineDescription, getOptionHolder, getPath, getProjectResourcePath, getProjectRoot, isInProjectRoot, loadUTGBConfig, maven, maven
 
クラス org.utgenome.shell.UTGBShellCommandBase から継承されたメソッド
execute
 
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait
 

コンストラクタの詳細

Illumina2Fastq

public Illumina2Fastq()
メソッドの詳細

execute

public void execute(String[] args)
             throws Exception
定義:
インタフェース org.xerial.util.opt.Command 内の execute
定義:
クラス UTGBShellCommand 内の execute
例外:
Exception

getOneLinerDescription

public String getOneLinerDescription()
定義:
クラス UTGBShellCommand 内の getOneLinerDescription

name

public String name()
定義:
インタフェース org.xerial.util.opt.Command 内の name
定義:
クラス UTGBShellCommand 内の name


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